Na podstawie Statutu Fundacji (§16 ust. 1 oraz §20 ust. 1), Zarząd PKP S.A. powołuje organy statutowe Fundacji: Radę Fundacji oraz Zarząd Fundacji.
W skład Rady Fundacji wchodzą:
Dariusz Grajda – przedstawiciel PKP S.A., Przewodniczący Rady Fundacji Grupy PKP
Paweł Lisiewicz – przedstawiciel PKP S.A., Członek Rady Fundacji Grupy PKP
Krzysztof Dobies – przedstawiciel PKP S.A., Członek Rady Fundacji Grupy PKP
Krzysztof Hantz – przedstawiciel PKP S.A., Członek Rady Fundacji Grupy PKP
Zbigniew Ciemny – Przedstawiciel PKP Intercity S.A., Członek Rady Fundacji Grupy PKP
Małgorzata Kuczewska-Łaska – Przedstawiciel PKP Polskich Linii Kolejowych S.A., Członek Rady Fundacji Grupy PKP
Dariusz Wojciechowski – Przedstawiciel PKP Telkol sp. z o.o., Członek Rady Fundacji Grupy PKP
Paweł Miłek – Przedstawiciel PKP CARGO S.A., Członek Rady Fundacji Grupy PKP
Pracami Fundacji kieruje Zarząd Fundacji w składzie:
Radosław Konieczny – Prezes Zarządu